ECCUBEを普通にインストールしたら文字化けしました。
どうやら、mysqlの文字コードがutfだったからのようで。。。
原因はあまりよく理解していないのですが、どうやら

data/class/SC_DbConn.php を編集すれば解決できます。

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　$objDbConn = DB::connect($dsn, $options);
　$buf = $objDbConn->prepare('SET NAMES utf8');
　$objDbConn->execute($buf);```

50行目をこんな感じで修正すれば大丈夫です。